46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6297 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  89.41 
 
 		 406 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  778    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  58.23 
 
 		 565 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  59.42 
 
 		 553 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  57.43 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  55.41 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  47.83 
 
 		 486 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  46.07 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  46.04 
 
 		 556 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  44.94 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  46.72 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  46.72 
 
 		 389 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  44.13 
 
 		 391 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  39.06 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  36.43 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  34.93 
 
 		 380 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  38.8 
 
 		 377 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  34.82 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  36.31 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  32.02 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  32.51 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  29.07 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.69 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  30.38 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  32.02 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  27.76 
 
 		 352 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  28.08 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  32.87 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  27.61 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  27.87 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  31.34 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  25.16 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  24.18 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  34.96 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  33.06 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  27.34 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  30.77 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  33.58 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  29.5 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  26.51 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  34.68 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  27.5 
 
 		 371 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  26.5 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.92 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>