34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3009 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  61.52 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  60.38 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  56.67 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  54.47 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  55.8 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  59.92 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  37.15 
 
 		 359 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  35.1 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  35.46 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  34.73 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  36.39 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  33.24 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  34.75 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  32.33 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  34.58 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  34.55 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  28.41 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  30.06 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  35.68 
 
 		 335 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  26.61 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.18 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  33.16 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  25.63 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  31.91 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  25.56 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  28.63 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  27.7 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  26.92 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  25.74 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  32.5 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  32.54 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  26.06 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  37.01 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>