34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4637 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  37.36 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  36.52 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  36.16 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  35.83 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  37.15 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  36.24 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  36.52 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  36.54 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  34.28 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  36.47 
 
 		 361 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  34.27 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  35.24 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  32.05 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  31.42 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  33.55 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  26.05 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  29.33 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  29.52 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  26.91 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  29.35 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  30.21 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  28.47 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  29.75 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  29.45 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  27.31 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  33.11 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  23.57 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  32.99 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  28.79 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  31.15 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  31.62 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>