37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0235 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  70.19 
 
 		 361 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  61.73 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  37.01 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  34.08 
 
 		 377 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  35.34 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  34.08 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  36.47 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  35.83 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  34.01 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  34.16 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  34.44 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  34.73 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  30.68 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  32.24 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  33.83 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  28.83 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  27.86 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  26.86 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  27.07 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  35.19 
 
 		 335 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  25.8 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  25.27 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  33.87 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  29.94 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  25.79 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  24.92 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  29.48 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.76 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  22.86 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  29.48 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  26.32 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  40.38 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  38.46 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  26.02 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  27.68 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>