17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1016 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  91.72 
 
 
338 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1315  hypothetical protein  51.95 
 
 
348 aa  296  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0620  hypothetical protein  46.58 
 
 
352 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2680  hypothetical protein  26.8 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0880  hypothetical protein  27.56 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0580  hypothetical protein  26.74 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0580  hypothetical protein  26.39 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  43.28 
 
 
371 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  27.17 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  33.64 
 
 
370 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  43.28 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  30.43 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  28.1 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  38.46 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  32 
 
 
409 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  33.68 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>