17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0889 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  91.72 
 
 
349 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1315  hypothetical protein  50.75 
 
 
348 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0620  hypothetical protein  47.18 
 
 
352 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2680  hypothetical protein  26.8 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0880  hypothetical protein  27.48 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0580  hypothetical protein  27.08 
 
 
358 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0580  hypothetical protein  26.74 
 
 
358 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  44.78 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  27.17 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  44.78 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  30.43 
 
 
361 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  30.43 
 
 
361 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  40.38 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  46.94 
 
 
372 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  32 
 
 
409 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>