9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0620 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  46.58 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  47.18 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1315  hypothetical protein  42.38 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2680  hypothetical protein  27.34 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0880  hypothetical protein  38.24 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0580  hypothetical protein  30.66 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0580  hypothetical protein  30.66 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1947  hypothetical protein  32.35 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.757191  normal  0.0957628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>