14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0880 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0880  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  587  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2680  hypothetical protein  29.3 
 
 
344 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  27.56 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  27.48 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0620  hypothetical protein  38.24 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0580  hypothetical protein  30.26 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0580  hypothetical protein  29.89 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1315  hypothetical protein  42.86 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  40.28 
 
 
409 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  37.37 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  33.9 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  39.76 
 
 
565 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  39.76 
 
 
565 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>