42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5421 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  38.87 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  36.54 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  37.5 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  33.98 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  35.2 
 
 		 371 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  33.88 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  33.9 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  36.39 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  33.43 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  31.04 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  31.68 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  32.34 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  30.68 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  36.53 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  31.05 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  29.47 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  34.55 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  26.84 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  28.35 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26.33 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  29.38 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  32.83 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  34.93 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  28.93 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  28.66 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  27.38 
 
 		 406 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  34.17 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  33.91 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  31.29 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  27.47 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  31.37 
 
 		 553 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  26.02 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  28.4 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  30.82 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  29.31 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  31.58 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  33.64 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  28.38 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  27.7 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>