31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1660 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  946    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  65.3 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  77.31 
 
 		 391 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  77.84 
 
 		 393 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  77.57 
 
 		 391 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  74.67 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  72.7 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  45.78 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  47.83 
 
 		 406 aa  273  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  43.35 
 
 		 565 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  42.93 
 
 		 553 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  43.09 
 
 		 565 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  41.33 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  37.83 
 
 		 381 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  37.3 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  40.71 
 
 		 377 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  39.53 
 
 		 376 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  36.29 
 
 		 380 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  34.12 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  36.64 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  32.62 
 
 		 377 aa  153  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  29.77 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  31.82 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.31 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  27.47 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  25.42 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  25.16 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  27.91 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.2 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  26.7 
 
 		 361 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  27.7 
 
 		 370 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>