35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1356 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  814    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  40.66 
 
 
363 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  31.17 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  27.68 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  32.61 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  29.35 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  31.79 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  23.53 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  23.6 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  24.58 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  23.84 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  25.27 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  25.23 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  23.95 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  26.07 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  36.45 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  24.54 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  22.69 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  24.01 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  27.38 
 
 
370 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  28.87 
 
 
377 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  22.97 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  35.2 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  23.5 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  29.85 
 
 
553 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  29.85 
 
 
565 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  32.35 
 
 
503 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  28.87 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  29.1 
 
 
565 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  31.71 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  25.09 
 
 
268 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  31.34 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  28.7 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  32.2 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  27.66 
 
 
336 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>