44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1839 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  714    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  32.43 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  26.4 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  23.97 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  24.76 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  29.13 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  31.6 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  23.7 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  28.7 
 
 		 565 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  26.6 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  21.31 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  28.14 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  31.2 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  28.12 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  24.41 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  24.35 
 
 		 556 aa  59.3  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  23.95 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  25.79 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  21.78 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  30.66 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  25.21 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  28.95 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  24.1 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  26.75 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  31.08 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  25.42 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  33.12 
 
 		 398 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  31.06 
 
 		 372 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  27.11 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  25.43 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  29.88 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  28.02 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  24.86 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  33.58 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  32.5 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  32.5 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  30.71 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  26.51 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  25.81 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  22.68 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  27.13 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>