39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2660 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  749    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  68.6 
 
 		 373 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  67.21 
 
 		 371 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  63.39 
 
 		 371 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  63.41 
 
 		 369 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  80.83 
 
 		 268 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  60.38 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  39.37 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  38.87 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  36.24 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  35.01 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  33.98 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  34.08 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  34.81 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  33.05 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  31.61 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  27.25 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  36.65 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  30.21 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  32.4 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  32.88 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  23.51 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  27.36 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  31.97 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  24.54 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  23.8 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  28.87 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  26.99 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  31.06 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  27.04 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  30.39 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  28.74 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  28.28 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  26.34 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  28.28 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  25.81 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  27.63 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>