42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3863 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  747    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  76.61 
 
 		 391 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  75.96 
 
 		 393 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  72.63 
 
 		 391 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  72.7 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  69.31 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  66.93 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  44.88 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  46.94 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  44.68 
 
 		 565 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  44.68 
 
 		 565 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  44.8 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  40.81 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  35.05 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  35.26 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  34.51 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  35.85 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  37.33 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  34.74 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  36.86 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  35.64 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  30.65 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  31.42 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  27.59 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  26.7 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  32.24 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  28.48 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  31.5 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  30.97 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  26.3 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  26.27 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  29.31 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  27.33 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  22.07 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  26.09 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  35.42 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  28.79 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  25.93 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  27.03 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  30.41 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  37.01 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>