40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2020 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  74.39 
 
 		 371 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  73.58 
 
 		 371 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  63.44 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  63.41 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  55.8 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  61.65 
 
 		 268 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  35.47 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  35.11 
 
 		 361 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  34.28 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  34.2 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  35.83 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  33.43 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  34.2 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  32.53 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  30.61 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  27.37 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  25.8 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  32.92 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  24.62 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  23.84 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  31.76 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  36.28 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  25.68 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  30.66 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  30.08 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  25.32 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  27.81 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  25.89 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  31.5 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  27.81 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  30.23 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  27.33 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  31.45 
 
 		 556 aa  46.2  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  31.21 
 
 		 565 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  29.46 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  30.39 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  30.16 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  28.68 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>