43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0867 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  716    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  31.17 
 
 		 406 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  29.68 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.27 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  27.46 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  34.25 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  26.69 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  25.74 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  25.81 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  34.42 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  34.19 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  34.19 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  25.82 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  26.6 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  30.99 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  29.17 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  26.29 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  31.95 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  31.46 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  34.96 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  30.52 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  23.62 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  25.46 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  30.11 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  32.37 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  22.59 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  27.86 
 
 		 376 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  33.09 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  25.43 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  32.21 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  30.71 
 
 		 553 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  27.03 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  29.46 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  27.86 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  24.4 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  29.79 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  29.25 
 
 		 565 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  30.22 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  27.73 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  29.25 
 
 		 565 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3210  hypothetical protein  29.27 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325243  normal  0.217196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>