37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1913 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  82.21 
 
 		 371 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  73.58 
 
 		 369 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  63.17 
 
 		 373 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  63.39 
 
 		 372 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  54.47 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  56.87 
 
 		 268 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  36.71 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  36.54 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  36.52 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  35.28 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  36.26 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  35.34 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  33.51 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  32.78 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  32.35 
 
 		 375 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  28.18 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  26.32 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  25.29 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  29.26 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  34.4 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  25.93 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  23.91 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  27.98 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  34.17 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  22.71 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  31.08 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  25.82 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  22.97 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0889  hypothetical protein  44.78 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1016  hypothetical protein  43.28 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  29.37 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  29.94 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  30.85 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  28.72 
 
 		 556 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  25.09 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  30.61 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>