34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1956 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  29.38 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  30.43 
 
 		 392 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  26.14 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  28.8 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  26.33 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  31.25 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  30.21 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  29.67 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  29.69 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  25.23 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  30.99 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  26.69 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  38.13 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  31.72 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  27.49 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  23.91 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  34.82 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  28.95 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  31.76 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  31.46 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  31.54 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  28.1 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  33.12 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  28.52 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  28.1 
 
 		 371 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  26.88 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  27.33 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  29.51 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  30.6 
 
 		 556 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  27.91 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  27.72 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  27.82 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  28.24 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>