32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6078 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  796    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  41.34 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  40.5 
 
 		 377 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  38.04 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  39.26 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0444  hypothetical protein  33.62 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  35.77 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1744  hypothetical protein  35.24 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  36.26 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  35.1 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  35.51 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  33.9 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  34.01 
 
 		 361 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  34.2 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  35.24 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  32.04 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2250  hypothetical protein  34.47 
 
 		 268 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  29.74 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  28.25 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1956  hypothetical protein  30.43 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409971  normal  0.086997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  29.44 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  34.51 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  26.84 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  24.28 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  28.12 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  30 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  24.1 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  22.55 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  26.23 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  25.25 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  25.82 
 
 		 503 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>