37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1014 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  744    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  48.22 
 
 
376 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  45.6 
 
 
381 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  41.24 
 
 
380 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  41.14 
 
 
382 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  37.2 
 
 
391 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  38.56 
 
 
556 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  36.63 
 
 
486 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  44.15 
 
 
377 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  34.24 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  36.14 
 
 
393 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  37.42 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  36.02 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  35.41 
 
 
503 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  36.83 
 
 
406 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  36.53 
 
 
565 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  37.14 
 
 
565 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  37.61 
 
 
406 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  35.92 
 
 
553 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  29.34 
 
 
377 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  28.16 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  28.26 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  26.41 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  30.51 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.55 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  24.41 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  25.41 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  33.91 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  34.36 
 
 
444 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  26.22 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  31.96 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  29.23 
 
 
372 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  28.79 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  35.63 
 
 
133 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1913  hypothetical protein  25.37 
 
 
371 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171289  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  30.07 
 
 
361 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  30.66 
 
 
361 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>