27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2223 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  755    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  53.21 
 
 		 381 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  53.74 
 
 		 380 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  44.47 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  41.14 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  40.19 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  39.13 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  36.69 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  39.63 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  34.12 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  36.04 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  34.36 
 
 		 553 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  34.28 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  34.02 
 
 		 565 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  32.98 
 
 		 393 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  34.52 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  32.57 
 
 		 556 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  34.74 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  30.38 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  27.72 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  26 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  24.04 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  30.5 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  24.05 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  30.11 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  25.79 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>