17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4665 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0708  hypothetical protein  51.21 
 
 
328 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0697  hypothetical protein  51.21 
 
 
328 aa  292  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0670  hypothetical protein  52.59 
 
 
331 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  50.82 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  49.33 
 
 
373 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1947  hypothetical protein  27.6 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.757191  normal  0.0957628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3512  hypothetical protein  42.17 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652436  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3048  hypothetical protein  43.37 
 
 
320 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442334  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1399  hypothetical protein  37.93 
 
 
320 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.647959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1139  hypothetical protein  40.24 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.888592  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2066  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1782  hypothetical protein  37.8 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2660  hypothetical protein  29.94 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3009  hypothetical protein  33.14 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  23.63 
 
 
392 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0235  hypothetical protein  27.32 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>