More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2878 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6142  TatD-related deoxyribonuclease  39.83 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0939  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1469  TatD-related deoxyribonuclease  38.12 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170381  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  35.98 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  36.61 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4247  TatD-related deoxyribonuclease  34.19 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.555643  decreased coverage  0.000153731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0664  TatD-related deoxyribonuclease  34.16 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5067  TatD-related deoxyribonuclease  31.56 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3158  TatD-related deoxyribonuclease  31.56 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5210  TatD-related deoxyribonuclease  32.41 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  30.65 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  32.02 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  32.51 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  31.6 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  30.28 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2167  TatD-related deoxyribonuclease  30.04 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  27.06 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  28.51 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  30.4 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  30.9 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02480  Mg-dependent DNase  28.92 
 
 		 319 aa  95.1  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.03042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  30.92 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  29.96 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  29.69 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  31.18 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  30.7 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  30.74 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  30.7 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  31.43 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  30.2 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  28.81 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  29.96 
 
 		 262 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  29.07 
 
 		 262 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  29.96 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  29.96 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  29.96 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  28.35 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22950  Mg-dependent DNase  32.67 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00452809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  27.34 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.98 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  29.02 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  25.3 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  28.33 
 
 		 261 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  29.03 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  30.2 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  33.16 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  26.95 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  28.91 
 
 		 263 aa  88.6  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  32.62 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  28.83 
 
 		 457 aa  88.6  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  29.53 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  28.91 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  29.44 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  26.87 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  32.05 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  26.34 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  27.93 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  27.63 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  27.59 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  28.12 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  27.24 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  29.64 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  29.13 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  28.27 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  31.66 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  31.48 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  29.41 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  27.39 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3651  TatD-related deoxyribonuclease  35.81 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  28.74 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  30.3 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  29.83 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  29.57 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  29.89 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  23.53 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  28.96 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  28.82 
 
 		 262 aa  85.1  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  31.74 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  25.68 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0618  TatD-related deoxyribonuclease  27.7 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.189255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  25.87 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  32.88 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  28.91 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  29.72 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  31.09 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  30.71 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0212  hydrolase, TatD family  28.57 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.02285e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  25.68 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  29.57 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  25.4 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  28.68 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  30.71 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  27.38 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  29.96 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  25.75 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>