More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0890 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  100 
 
 		 269 aa  565  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  93.68 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  78.46 
 
 		 262 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  46.95 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  46.18 
 
 		 258 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  45.21 
 
 		 259 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  44.62 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  44.44 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  44.44 
 
 		 255 aa  235  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  46.18 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  45.35 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  44.23 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  46.54 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  44.02 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  46.52 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  44.98 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  43.24 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  43.63 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  45.35 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  43.24 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  45.22 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  43.51 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  43.85 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  45.22 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  42.53 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  43.73 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  44.85 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  44.85 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  40.86 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  43.35 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  42.69 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  44.24 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  45.98 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  43.08 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  43.13 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  44.83 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  43.08 
 
 		 269 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  43.08 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  42.69 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  43.08 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  42.31 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  42.91 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  42.69 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  42.31 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  42.53 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  42.53 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  42.53 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  42.53 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  42.15 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  42.53 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  43.87 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  43.87 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  41 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  41.15 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  42.15 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  42.31 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  42.08 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  42.31 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  41.38 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  41.15 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  43.56 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  43.94 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  42.26 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  40.77 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  41.54 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  42.08 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  42.47 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  39.62 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  40.38 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  41.54 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  43.08 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  41.15 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  42.42 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  42.42 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  42.42 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  40.68 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  43.08 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  39.77 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  39.62 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  42.42 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>