More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4247 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4247  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 237 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.555643  decreased coverage  0.000153731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0664  TatD-related deoxyribonuclease  54.01 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6142  TatD-related deoxyribonuclease  49.58 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2167  TatD-related deoxyribonuclease  42.67 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0939  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1469  TatD-related deoxyribonuclease  40.59 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170381  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5067  TatD-related deoxyribonuclease  42.44 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3158  TatD-related deoxyribonuclease  42.44 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2208  TatD-related deoxyribonuclease  39.33 
 
 		 267 aa  191  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5210  TatD-related deoxyribonuclease  40.45 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2262  TatD-related deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.225639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  32.9 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22950  Mg-dependent DNase  36.87 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00452809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0618  TatD-related deoxyribonuclease  37.98 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.189255 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02480  Mg-dependent DNase  28.96 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.03042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  30.25 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  29.9 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2029  TatD-related deoxyribonuclease  26.67 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.755342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  31.09 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  31.16 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  29.1 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  30.54 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  29.47 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  27.78 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  26.19 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  30.22 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  30.24 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  27.54 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  28.36 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  27.6 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  28 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.49 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  30.85 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  31.5 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  31.5 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  31.5 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  25 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  22.94 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  27.38 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  26.32 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  25.1 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  26.09 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  26.32 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  26.01 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  27.5 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  25.78 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64467  predicted protein  32.81 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  29.67 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  24.8 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  26.7 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  26.98 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  26.7 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  23.63 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  30.5 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  25.73 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  29.41 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  28.85 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  29.48 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  28.98 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  26.98 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  26.94 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  26.84 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.52 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  29.81 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  29.81 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  30.36 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  25.99 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  29.48 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  29.81 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  29.81 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  30.14 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  29.81 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  28.97 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  26.24 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  27.73 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1177  hydrolase TatD family  31.43 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00325246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  26.07 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  27.59 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.52 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  29.81 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  28.3 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1030  TatD-related deoxyribonuclease  25.5 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  28.71 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04900  Mg-dependent DNase  31.64 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.583954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  27.09 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  24.88 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  28.1 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  31.74 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  30.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  27.45 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  28.43 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  28.08 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  31.25 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  27.9 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  28.23 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  26.61 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  27.27 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>