106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0201 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  100 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  95.77 
 
 		 284 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  84.8 
 
 		 294 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  48.54 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  47.08 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  47.81 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  44.68 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  46.05 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  47.14 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  43.82 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  45.94 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  39.32 
 
 		 664 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  47.34 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  37.16 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  43.45 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  39.73 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  25.5 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  19.43 
 
 		 516 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 748 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  22.94 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  34 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 891 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  38.1 
 
 		 474 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 		 717 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 717 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.73 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.73 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  26.73 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.73 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  26.52 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 836 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3576  glycosyl transferase  30.56 
 
 		 410 aa  48.9  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 710 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  33.8 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 551 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 683 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 841 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.33 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  25.82 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 617 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  30.57 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 		 733 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 477 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 884 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  30.52 
 
 		 740 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  27.49 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 		 924 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.27 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5379  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 619 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  32.39 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  34.93 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 455 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  23.76 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  29.49 
 
 		 470 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5508  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 		 361 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30.26 
 
 		 700 aa  43.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  25.97 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  32.17 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3440  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>