24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01232 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  100 
 
 		 327 aa  682    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  28.04 
 
 		 664 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  28.53 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  25.34 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  25.84 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  24.3 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  24.24 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  25.68 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  26.3 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.99 
 
 		 2401 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 785 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 834 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 		 444 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  25.61 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>