48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  597  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  49.49 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  44.67 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  47.26 
 
 		 288 aa  215  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  45.07 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  36.43 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  35.93 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  36.86 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  34.11 
 
 		 664 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  39.3 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  28.53 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  33.16 
 
 		 474 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  22.28 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 425 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 684 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3392  glycosyl transferase, family 2  25.3 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000856485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  33.9 
 
 		 515 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1777  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.245156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  26.86 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 725 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  36.21 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.54 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 684 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 551 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 		 419 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  31.67 
 
 		 516 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2055  putative glycosyltransferase  34.02 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155199  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  31.65 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  40 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 670 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.42 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>