30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0721 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  50.69 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  53.18 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  44.67 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  47.81 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  44.36 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  44.87 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  43.45 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 		 283 aa  158  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  39.63 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  40.52 
 
 		 664 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  24.3 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  22.02 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 684 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  21.15 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 		 419 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>