94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0285 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  100 
 
 
294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  84.8 
 
 
296 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  85.21 
 
 
284 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  46.74 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  46.74 
 
 
313 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  46.57 
 
 
313 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  49.13 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  47.52 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  48.94 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  45.25 
 
 
275 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  42.23 
 
 
664 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  46.57 
 
 
283 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  39.86 
 
 
301 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  43.94 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  36.86 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  24.08 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  34.46 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
280 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
425 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
748 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  37.67 
 
 
474 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  22.27 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
336 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
1275 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
345 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
841 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
717 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
635 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
683 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
733 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
305 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
834 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
531 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
551 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
717 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
1077 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  34.81 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  24.49 
 
 
312 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  23.48 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
891 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  30.45 
 
 
470 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1777  hypothetical protein  25.2 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.245156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
670 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
746 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
836 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.77 
 
 
792 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  29.41 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  29.61 
 
 
740 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
662 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
513 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  31.73 
 
 
561 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
539 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
361 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
322 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.08 
 
 
860 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
352 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
710 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.46 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>