65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3906 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 834 aa  1742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5002  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000902541 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  27.85 
 
 		 726 aa  253  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.56 
 
 		 2401 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1777  hypothetical protein  25.49 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.245156  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.33 
 
 		 316 aa  54.3  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1537  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 312 aa  54.3  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1685  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 315 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.388329  normal  0.0473915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 288 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 455 aa  52.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 691 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 280 aa  51.2  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 304 aa  50.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 425 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  27.91 
 
 		 295 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 		 738 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1578  glycosyl transferase  31.86 
 
 		 183 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0848772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 528 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 313 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 390 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 		 313 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  22.41 
 
 		 413 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3505  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 327 aa  48.9  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6726e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 333 aa  48.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 415 aa  48.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  24.24 
 
 		 740 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 747 aa  47.8  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 328 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 307 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 311 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 581 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 289 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 403 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 419 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 		 323 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 272 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 270 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  24.31 
 
 		 327 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  33.63 
 
 		 292 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 336 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 298 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.8 
 
 		 310 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 649 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 280 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 452 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 398 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 684 aa  45.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 398 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 398 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  26.98 
 
 		 417 aa  45.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 444 aa  45.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 310 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 235 aa  44.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 310 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 		 278 aa  44.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 344 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 344 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 430 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 585 aa  44.3  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  24.56 
 
 		 410 aa  44.3  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 393 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  24.56 
 
 		 410 aa  44.3  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 691 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4179  Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase  23.16 
 
 		 847 aa  44.3  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 247 aa  44.3  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>