270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3505 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3505  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
327 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6726e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3440  glycosyl transferase family 2  62.46 
 
 
324 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1537  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 
312 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1685  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.388329  normal  0.0473915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2532  b-glycosyltransferase  33.05 
 
 
300 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.675462  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2244  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
293 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0294  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.75 
 
 
296 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.14411 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00160  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.418632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
310 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
329 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  30.23 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.3 
 
 
408 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.08 
 
 
941 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.11 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  25.35 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 
327 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 
327 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.13 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.13 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
609 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
374 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  24.68 
 
 
272 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
234 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 
327 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
327 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
261 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  27.59 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
684 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  28.8 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.57 
 
 
1161 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  31.25 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
525 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  25.5 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.33 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  30.54 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
430 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  27.33 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.33 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
528 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  32.12 
 
 
1169 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
351 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.33 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0494  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
674 aa  50.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1431  glycosyltransferase-like protein  29.93 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.32 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  26.4 
 
 
238 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0476  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
534 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0416  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.17 
 
 
534 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
312 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
227 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
260 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  26.09 
 
 
310 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0505  group 2 family glycosyl transferase  29.17 
 
 
528 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  37.76 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
227 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
336 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.09 
 
 
329 aa  49.3  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.7 
 
 
266 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  34.62 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  34.09 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  25.34 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
834 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.08 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  25.71 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.65 
 
 
1157 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
1035 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>