186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3440 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3440  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 324 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3505  glycosyl transferase family 2  62.46 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6726e-25 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1537  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1685  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.388329  normal  0.0473915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2244  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0294  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.94 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.14411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2532  b-glycosyltransferase  31.74 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.675462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00160  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 		 281 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.418632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 704 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.42 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 280 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  27.44 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 		 619 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 573 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 573 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.38 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.85 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  35.78 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.38 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 430 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 1739 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  34.88 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 884 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 684 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0484  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  25.67 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.98 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.19 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  35.34 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.71 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0476  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 		 534 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1269  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  28 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0505  group 2 family glycosyl transferase  36.36 
 
 		 528 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.75 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  26.21 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.78 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0416  cell wall biogenesis glycosyltransferase  36.36 
 
 		 534 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 232 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 1340 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3670  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.43 
 
 		 408 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 334 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.93 
 
 		 2401 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.74 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  33.98 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>