67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02819 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  100 
 
 		 410 aa  855    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  97.73 
 
 		 401 aa  810    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  855    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  40.99 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  39.16 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.43 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  40.58 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  40.15 
 
 		 394 aa  275  8e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  39.9 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.84 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  39.59 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.55 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.41 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.92 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.84 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.84 
 
 		 400 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  36.84 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  36.84 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  36.84 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.05 
 
 		 408 aa  235  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  36.29 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  35.53 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  35.53 
 
 		 401 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  37.14 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  35.42 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.04 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.94 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  32.29 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.87 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  31.47 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.02 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.77 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  33.77 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.17 
 
 		 462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  34.96 
 
 		 650 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  36.15 
 
 		 672 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  31.99 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.85 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  32.55 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.81 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.37 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.81 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  29.52 
 
 		 429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  30.83 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 450 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  31.3 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  27.04 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  26.86 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  27.5 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  33.82 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  22.85 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  28.93 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  25.15 
 
 		 726 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001779  region 2 capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 834 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.175407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>