34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1436 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 726 aa  1453    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5002  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 786 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000902541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3906  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 834 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.175407 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1777  hypothetical protein  24.29 
 
 		 326 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.245156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1717  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsB  26.6 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.884908  hitchhiker  0.00000000153114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  27.38 
 
 		 401 aa  51.6  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 407 aa  50.8  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 455 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  24.26 
 
 		 381 aa  49.3  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 402 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  31.65 
 
 		 394 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  25.77 
 
 		 401 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 435 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  31.16 
 
 		 394 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  24.84 
 
 		 401 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  23.71 
 
 		 401 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  30.43 
 
 		 417 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  25.15 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  25.15 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 398 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 398 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 398 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 400 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  25.9 
 
 		 400 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  25.9 
 
 		 368 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  25.9 
 
 		 400 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  25.9 
 
 		 435 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 429 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  25.9 
 
 		 435 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>