67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1338 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  100 
 
 
401 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  69.5 
 
 
401 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  71.11 
 
 
435 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  71.11 
 
 
429 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  71.11 
 
 
400 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  69.25 
 
 
401 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  70.85 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  70.85 
 
 
435 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  70.85 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  67.34 
 
 
401 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  66.17 
 
 
402 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  71.04 
 
 
368 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  66.42 
 
 
402 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.82 
 
 
439 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.5 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.45 
 
 
435 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.2 
 
 
435 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.59 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.17 
 
 
408 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  40.2 
 
 
436 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.2 
 
 
436 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.29 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.75 
 
 
443 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.62 
 
 
455 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.6 
 
 
407 aa  259  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.11 
 
 
452 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.48 
 
 
444 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.95 
 
 
440 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.2 
 
 
420 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  39.8 
 
 
404 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  36.36 
 
 
413 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.34 
 
 
434 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.61 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  38.72 
 
 
440 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  35.7 
 
 
401 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  35.42 
 
 
410 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  35.42 
 
 
410 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  35.5 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  31.61 
 
 
392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.32 
 
 
450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  35.75 
 
 
438 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  32.99 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  32.73 
 
 
394 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  32.92 
 
 
434 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  33.76 
 
 
428 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  32.73 
 
 
395 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 
462 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  32.65 
 
 
440 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.89 
 
 
650 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  31.96 
 
 
429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.1 
 
 
672 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  27.86 
 
 
443 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.86 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  25.72 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  26.32 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  28.83 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  26.24 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  25 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1399  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.48 
 
 
602 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  22.05 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  27.38 
 
 
726 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1569  hypothetical protein  28.34 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>