62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2215 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  100 
 
 		 650 aa  1342    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  65.03 
 
 		 672 aa  814    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  37.92 
 
 		 392 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  38.82 
 
 		 394 aa  225  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  38.2 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  38.56 
 
 		 394 aa  224  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  38.04 
 
 		 395 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  37.3 
 
 		 440 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.41 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  35.58 
 
 		 401 aa  201  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.29 
 
 		 444 aa  201  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  34.96 
 
 		 410 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  34.96 
 
 		 410 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.82 
 
 		 408 aa  180  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 407 aa  170  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  30.89 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.68 
 
 		 439 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.81 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.01 
 
 		 435 aa  163  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.33 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.46 
 
 		 402 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  30.86 
 
 		 438 aa  160  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  30.1 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.15 
 
 		 422 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 		 435 aa  157  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  32.14 
 
 		 436 aa  156  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 		 436 aa  156  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.95 
 
 		 402 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  29.84 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.33 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  31.07 
 
 		 435 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  31.07 
 
 		 400 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  31.07 
 
 		 400 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 455 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  30.08 
 
 		 413 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  29.31 
 
 		 429 aa  150  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.46 
 
 		 452 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  30.93 
 
 		 404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  32.44 
 
 		 368 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 		 434 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  29.82 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  30.47 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 		 420 aa  143  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  28.83 
 
 		 440 aa  137  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 440 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  38.27 
 
 		 428 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  22.54 
 
 		 420 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 398 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 398 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 398 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  29.69 
 
 		 399 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 399 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 359 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  27.13 
 
 		 381 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  25.74 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>