67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4290 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 434 aa  881    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.36 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.25 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.66 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.66 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.2 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.39 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.65 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.9 
 
 		 452 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.01 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.53 
 
 		 436 aa  259  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  37.53 
 
 		 436 aa  259  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.4 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  35.25 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.72 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.07 
 
 		 462 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  38.56 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  36.41 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  36.34 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  36.41 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.89 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.34 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  35.34 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  35.34 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.34 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  35.34 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  35.34 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.18 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.93 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  36.27 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  33.88 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  32.02 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  32.06 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.71 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  32.29 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  31.94 
 
 		 429 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  30.1 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  30.1 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  29.92 
 
 		 401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  33.52 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  26.03 
 
 		 392 aa  163  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  27.65 
 
 		 394 aa  156  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  27.39 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  31.79 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  27.37 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.03 
 
 		 650 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  29.34 
 
 		 672 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  26.72 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  22.33 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  21.37 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.37 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  23.79 
 
 		 399 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.15 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  30.15 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13038  hypothetical protein  27.52 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  30.23 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1569  hypothetical protein  27.97 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  26.06 
 
 		 726 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>