57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1558 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 440 aa  894    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  55.58 
 
 		 434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  55.34 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  55.9 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.94 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.9 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.52 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.46 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.46 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.42 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.96 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.9 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  33.9 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.62 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.02 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.36 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  33.08 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.95 
 
 		 429 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  34.95 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.26 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.95 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  33.93 
 
 		 401 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  33.93 
 
 		 401 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  34.69 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  34.69 
 
 		 400 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  34.69 
 
 		 400 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.75 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  36.41 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  32.34 
 
 		 401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  31.08 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  30.83 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  32.28 
 
 		 461 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  30.83 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.59 
 
 		 422 aa  177  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.79 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  32.65 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  35.17 
 
 		 368 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  27.3 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  32.48 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  28.46 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.78 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  27.49 
 
 		 394 aa  156  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  30.1 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  27.23 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  29.38 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.26 
 
 		 672 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  28.83 
 
 		 650 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  24.47 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  26.61 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1399  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 602 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5727  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 514 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  28 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>