65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2620 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 436 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  100 
 
 		 436 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  47.78 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.32 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.99 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.23 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  43.69 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.99 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.93 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.03 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  40 
 
 		 401 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  40 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.56 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  41.16 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.16 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.16 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  40.91 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  40.91 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.86 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  40.91 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.13 
 
 		 443 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  40.51 
 
 		 401 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.37 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  38.56 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  39.67 
 
 		 368 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.53 
 
 		 434 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  38.56 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.05 
 
 		 455 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.5 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  37.35 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.9 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  36.5 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.62 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  35.06 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  35.42 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.82 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  33.93 
 
 		 394 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  34.19 
 
 		 394 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.68 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  34.04 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  33.77 
 
 		 410 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  33.77 
 
 		 410 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  33.9 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  33.68 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  35.51 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  29.9 
 
 		 392 aa  183  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  32.22 
 
 		 438 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  33.25 
 
 		 672 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  32.14 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  30.25 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  29.49 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  24.23 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.23 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.23 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.23 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  34.35 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.68 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  34.27 
 
 		 399 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1399  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.31 
 
 		 602 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  32.26 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>