65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2454 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 420 aa  858    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  50.51 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  50.13 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  47.85 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.48 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.22 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.73 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  42.86 
 
 		 401 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.36 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.95 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.95 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  40.95 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  40.95 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  40.95 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  40.95 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  40.1 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  40.1 
 
 		 401 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.37 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  41.37 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.38 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.27 
 
 		 439 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  41.29 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 		 455 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.07 
 
 		 407 aa  274  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.7 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.29 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  39.73 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.25 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.67 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  38.05 
 
 		 413 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.1 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  35.84 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.58 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.98 
 
 		 422 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.92 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  32.64 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  37.16 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  31.87 
 
 		 410 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  31.87 
 
 		 410 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  34.62 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  35.42 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  37.34 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  34.72 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  33.33 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  28.75 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  29.27 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  29.27 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  28.83 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  31.19 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.03 
 
 		 650 aa  150  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.73 
 
 		 672 aa  146  9e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  23.38 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  26.53 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  27.7 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  30.4 
 
 		 381 aa  50.1  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  27.67 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6267  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>