64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001786 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  100 
 
 		 420 aa  863    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  28.52 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  27.24 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  27.36 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  28.23 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  27.36 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  27.36 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  27.05 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  27.05 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  24.47 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  24.53 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  22.99 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  23.78 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  21.78 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  24.23 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  22.32 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  23.42 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  23.13 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  23.45 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  23.45 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  24.92 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  24.11 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  23.45 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  23.45 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  24.92 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  24.92 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  21.53 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  22 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  22.05 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  23.67 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  22.42 
 
 		 672 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.83 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  28.8 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  26.4 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  29.17 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6267  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>