67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0779 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 401 aa  830    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  99.75 
 
 		 401 aa  826    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  69.5 
 
 		 401 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  66.83 
 
 		 401 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  66.42 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  66.42 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  66.42 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  66.42 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  66.42 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  66.42 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  66.5 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  65.08 
 
 		 402 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  65.12 
 
 		 368 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.32 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.71 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.94 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.92 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.42 
 
 		 435 aa  322  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.42 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  40 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.1 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.1 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.1 
 
 		 407 aa  272  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.13 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.71 
 
 		 452 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  38.94 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.59 
 
 		 440 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  40.05 
 
 		 440 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.52 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.41 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.85 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.58 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  36.05 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  35.53 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  35.53 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  33.76 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  31.35 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  35.6 
 
 		 461 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.41 
 
 		 450 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  33.25 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  33.07 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  32.99 
 
 		 394 aa  209  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.99 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  32.47 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  31.83 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  33.93 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 438 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  31.09 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.87 
 
 		 672 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.1 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  28.89 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  27.9 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  23.68 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  28 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  29.74 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  29.13 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1569  hypothetical protein  32.28 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  24.84 
 
 		 726 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1399  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 602 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>