64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0464 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  100 
 
 		 672 aa  1374    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  65.34 
 
 		 650 aa  818    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  39.64 
 
 		 394 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  39.38 
 
 		 394 aa  233  9e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  39.68 
 
 		 461 aa  230  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  38.58 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  36.86 
 
 		 392 aa  228  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  38.46 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  36.79 
 
 		 401 aa  200  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  36.15 
 
 		 410 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  36.15 
 
 		 410 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.12 
 
 		 444 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.7 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 		 408 aa  180  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.05 
 
 		 450 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.33 
 
 		 407 aa  170  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.84 
 
 		 443 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.95 
 
 		 462 aa  168  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.96 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.84 
 
 		 402 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.91 
 
 		 435 aa  164  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 436 aa  164  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  33.25 
 
 		 436 aa  164  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  32.8 
 
 		 404 aa  163  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  30.87 
 
 		 401 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.95 
 
 		 435 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  29.98 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  30.61 
 
 		 401 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 		 422 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.85 
 
 		 429 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 435 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.85 
 
 		 400 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 428 aa  157  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 		 402 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  30.1 
 
 		 401 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  31.13 
 
 		 401 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  31.59 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  31.59 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  31.59 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2214  capsule polysaccharide protein KpsS-like  38.57 
 
 		 250 aa  154  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0427805  normal  0.950246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 440 aa  150  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 435 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  31.98 
 
 		 368 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 		 452 aa  147  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 		 434 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  28.05 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  29.92 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  27.66 
 
 		 413 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  30.26 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  28.53 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  21.22 
 
 		 420 aa  50.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.91 
 
 		 359 aa  48.9  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  24.09 
 
 		 425 aa  48.5  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  29.13 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  29.66 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.66 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0569  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.57 
 
 		 272 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1399  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 602 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>