66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2761 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  94.94 
 
 		 435 aa  807    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  99.54 
 
 		 435 aa  887    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 435 aa  890    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  71.26 
 
 		 435 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.44 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  44.44 
 
 		 401 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  44.44 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.58 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  44.05 
 
 		 401 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  45.48 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.86 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.91 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  42.86 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  43.91 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  43.91 
 
 		 435 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.91 
 
 		 429 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  43.91 
 
 		 400 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  43.91 
 
 		 400 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.91 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.59 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.85 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.22 
 
 		 440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.35 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.65 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.15 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.15 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  46.1 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  42.35 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.83 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.79 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  36.04 
 
 		 413 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.61 
 
 		 462 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.45 
 
 		 420 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  36.46 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  33.66 
 
 		 434 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.6 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  30.57 
 
 		 392 aa  208  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  34.21 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  33.57 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  29.08 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  28.83 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  28.94 
 
 		 395 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  30.1 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  29.87 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  29.87 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  32.11 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  32.55 
 
 		 650 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  30.5 
 
 		 672 aa  159  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  28.54 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  21.78 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  26.09 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 		 359 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13038  hypothetical protein  37.97 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  26.58 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1436  putative glycosyl transferase  31.01 
 
 		 726 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00321007  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  30.58 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>