70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5737 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  100 
 
 		 461 aa  941    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  41.92 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  40.79 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  40.58 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  40.58 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.43 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0319  capsular polysaccharide export protein KpsS  34.74 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1412  capsule polysaccharide export protein KpsS  36.32 
 
 		 394 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1600  capsule polysaccharide export protein KpsS  36.05 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.105015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1746  capsule polysaccharide export protein KpsS  37.34 
 
 		 395 aa  252  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.33 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0464  capsule polysaccharide protein KpsS-like  39.68 
 
 		 672 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0858219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1149  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.99 
 
 		 402 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0890377  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.76 
 
 		 429 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  38.24 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.7 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1536  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.05 
 
 		 408 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2215  capsule polysaccharide protein KpsS-like  38.2 
 
 		 650 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3913  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.74 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  37.98 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  37.98 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  37.98 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1338  WcbO  35.5 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0779  capsule polysaccharide biosynthesis  35.6 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0296  capsule polysaccharide biosynthesis  35.6 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3870  capsule polysaccharide biosynthesis  37.44 
 
 		 401 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2118  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.27 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107224  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1939  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.05 
 
 		 455 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0748  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.11 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4943  capsule polysaccharide biosynthesis  32.64 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  37.22 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2620  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3013  capsule polysaccharide modification protein  35.51 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0323  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1285  capsule polysaccharide biosynthesis  37.22 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0947  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.42 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2615  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.12 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2253  putative capsule polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.724395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2454  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2753  capsule polysaccharide biosynthesis  30.89 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0193  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.96 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.83 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1558  capsule polysaccharide biosynthesis  32.28 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394249  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2466  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.64 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.10918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2538  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4290  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.52 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2596  capsule polysaccharide biosynthesis  30.25 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322338  normal  0.0183226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2761  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.84 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.125812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1483  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0642  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.25 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2132  capsule polysaccharide biosynthesis  30.45 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3418  capsule polysaccharide biosynthesis  31.23 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0404344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001786  phosphoribosylamine-glycine ligase  23.28 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  34.62 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.24 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1356  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0610  putative capsule polysaccharide export protein  26.03 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  21.74 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6267  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001779  region 2 capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.68 
 
 		 509 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5909  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.83 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.752817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6177  capsule polysaccharide biosynthesis  35 
 
 		 399 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7396  capsule polysaccharide biosynthesis  32.5 
 
 		 399 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3272  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  28.06 
 
 		 679 aa  47.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 513 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  38.64 
 
 		 326 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  31.11 
 
 		 663 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>