39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001779 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001779  region 2 capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 509 aa  1032    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5727  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.72 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5947  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  28.21 
 
 		 675 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  25.61 
 
 		 683 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  29.14 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 714 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5737  capsule polysaccharide modification protein  30.68 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  27.33 
 
 		 689 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 658 aa  50.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 747 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  27.56 
 
 		 688 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  27.65 
 
 		 683 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  25.5 
 
 		 674 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  30.64 
 
 		 675 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  30.64 
 
 		 675 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  30.64 
 
 		 677 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  29.11 
 
 		 690 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1303  capsule polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2330  capsule polysaccharide biosynthesis  32.99 
 
 		 440 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 673 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3224  polysialic acid capsule biosynthesis protein KpsS  29.55 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02769  hypothetical protein  29.55 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000176543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02819  KpsS protein  29.55 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000140465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2169  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  30.68 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3274  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.68 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3238  capsule polysaccharide biosynthesis protein  30.68 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.333462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1064  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  30.68 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0536  capsule polysaccharide biosynthesis/putative export protein  30.68 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3289  capsular polysaccharide export protein  30.68 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2292  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein. putative  30.68 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.672177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1850  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  24.07 
 
 		 663 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 665 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4291  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>