59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1747 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  87.76 
 
 		 690 aa  1213    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  67.1 
 
 		 675 aa  945    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  100 
 
 		 688 aa  1387    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  92.01 
 
 		 689 aa  1285    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.24 
 
 		 657 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  40.03 
 
 		 683 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.06 
 
 		 653 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  37.99 
 
 		 695 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  38.79 
 
 		 682 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  39.31 
 
 		 658 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  39.97 
 
 		 675 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  39.97 
 
 		 675 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.17 
 
 		 699 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  40.13 
 
 		 677 aa  426  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.84 
 
 		 684 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.18 
 
 		 673 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  37.69 
 
 		 674 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.77 
 
 		 714 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  34.93 
 
 		 650 aa  379  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 665 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  31.22 
 
 		 683 aa  335  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.72 
 
 		 658 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  34 
 
 		 661 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  29.45 
 
 		 679 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  30.6 
 
 		 663 aa  300  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  34.5 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  34.5 
 
 		 671 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.5 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.5 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  34.5 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  34.5 
 
 		 671 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  34.5 
 
 		 671 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  39.43 
 
 		 616 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  32.74 
 
 		 676 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  30.4 
 
 		 658 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  34.45 
 
 		 671 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  31.36 
 
 		 685 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.54 
 
 		 560 aa  246  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  33.19 
 
 		 645 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  33.19 
 
 		 642 aa  244  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  35.54 
 
 		 346 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.96 
 
 		 347 aa  230  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.96 
 
 		 347 aa  230  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.69 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  31.62 
 
 		 437 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  35.6 
 
 		 355 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.87 
 
 		 373 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  33.83 
 
 		 433 aa  195  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 649 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 649 aa  193  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 650 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.15 
 
 		 341 aa  184  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  33.91 
 
 		 326 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  34.63 
 
 		 326 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.43 
 
 		 747 aa  172  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001779  region 2 capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2589  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1460 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.305745  hitchhiker  0.0036664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02587  Capsule polysaccharide biosynthesis  29.27 
 
 		 417 aa  45.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0511504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>