58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1325 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  61 
 
 
578 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  60 
 
 
671 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  59.84 
 
 
671 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  60.65 
 
 
645 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  61.06 
 
 
578 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  60 
 
 
671 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  100 
 
 
676 aa  1320    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  63.5 
 
 
525 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  60.65 
 
 
642 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  63.5 
 
 
525 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  56.3 
 
 
685 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  55.32 
 
 
616 aa  631  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  53.81 
 
 
671 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  43.3 
 
 
695 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.73 
 
 
657 aa  349  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.64 
 
 
653 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  37.21 
 
 
675 aa  327  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  37.21 
 
 
675 aa  327  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  37.17 
 
 
677 aa  323  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  39.96 
 
 
674 aa  320  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.27 
 
 
699 aa  310  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  35.95 
 
 
683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.06 
 
 
684 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  32.74 
 
 
688 aa  301  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  31.63 
 
 
689 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  40.31 
 
 
650 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  33.72 
 
 
690 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  36.55 
 
 
658 aa  287  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  36.86 
 
 
682 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.51 
 
 
673 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  41.63 
 
 
658 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  32.43 
 
 
675 aa  278  3e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  36.36 
 
 
665 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.19 
 
 
714 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.24 
 
 
661 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  35.27 
 
 
679 aa  246  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  47 
 
 
346 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  38.71 
 
 
663 aa  241  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  37.24 
 
 
683 aa  225  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.94 
 
 
560 aa  224  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 
500 aa  219  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  34.99 
 
 
658 aa  216  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.04 
 
 
347 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.04 
 
 
347 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.76 
 
 
513 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  48.16 
 
 
373 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  44.48 
 
 
437 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  44.65 
 
 
355 aa  200  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.3 
 
 
649 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.65 
 
 
649 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  36.96 
 
 
650 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.7 
 
 
433 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.31 
 
 
341 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.67 
 
 
747 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  38.08 
 
 
326 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  35.48 
 
 
326 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2589  hypothetical protein  45.76 
 
 
1460 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.305745  hitchhiker  0.0036664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  26.42 
 
 
381 aa  44.3  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>