62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2755 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2755  capsule polysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 674 aa  1367    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2616  capsule polysaccharide biosynthesis protein  53.62 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3912  capsule polysaccharide biosynthesis protein  51.76 
 
 		 673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2216  polysaccharide export protein  50.97 
 
 		 650 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.245029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0463  polysaccharide export protein  48.87 
 
 		 665 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001778  capsule polysaccharide modification protein  43.06 
 
 		 658 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02818  Capsule polysaccharide export protein KpsC  44.43 
 
 		 675 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000081315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02768  hypothetical protein  44.43 
 
 		 675 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000859987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2595  capsule polysaccharide biosynthesis  42.35 
 
 		 683 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00683877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3223  polysialic acid capsule polysaccharide export protein KpsC  44.12 
 
 		 677 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5948  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.92 
 
 		 699 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2331  capsule polysaccharide biosynthesis  41.09 
 
 		 695 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5736  capsule polysaccharide modification protein  41.72 
 
 		 682 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1601  capsule polysaccharide export protein KpsC  36.76 
 
 		 690 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1413  capsule polysaccharide export protein KpsC  38.32 
 
 		 689 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.38162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0318  capsular polysaccharide export protein KpsC  38.07 
 
 		 675 aa  409  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1747  capsule polysaccharide export protein KpsC  37.69 
 
 		 688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1314  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.42 
 
 		 657 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1504  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.49 
 
 		 653 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2134  capsule polysaccharide biosynthesis  40.46 
 
 		 679 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3917  capsule polysaccharide biosynthesis protein  40.73 
 
 		 714 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.442533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1560  capsule polysaccharide biosynthesis  39.87 
 
 		 663 aa  359  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.025532  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1535  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  53.61 
 
 		 346 aa  353  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3420  capsule polysaccharide biosynthesis  40.13 
 
 		 683 aa  346  7e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2187  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  45.87 
 
 		 525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0519  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  45.87 
 
 		 525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3303  WcbA  45.87 
 
 		 671 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3292  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.87 
 
 		 578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1080  putative capsule polysaccharide biosynthesis/export protein  45.87 
 
 		 671 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2309  capsule polysaccharide biosynthesis/export protein, putative  45.87 
 
 		 671 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.301834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3257  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.63 
 
 		 578 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0738  capsule polysaccharide biosynthesis protein  45.84 
 
 		 685 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3857  capsule polysaccharide biosynthesis  44.87 
 
 		 616 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0321  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.52 
 
 		 661 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1941  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.79 
 
 		 658 aa  316  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2255  putative capsule polysaccharide export protein  37.54 
 
 		 658 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1325  WcbA  39.96 
 
 		 676 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3012  capsule polysaccharide biosynthesis protein  53.05 
 
 		 347 aa  301  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2619  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  53.05 
 
 		 347 aa  301  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0769  capsule polysaccharide biosynthesis  42.57 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0285  capsule polysaccharide biosynthesis  42.57 
 
 		 642 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.812993  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4923  capsule polysaccharide biosynthesis  50.78 
 
 		 355 aa  292  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1163  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.96 
 
 		 671 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0373646  normal  0.786795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0731  capsule polysaccharide biosynthesis  49.5 
 
 		 326 aa  278  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0612  putative polysaccharide export protein  52.1 
 
 		 326 aa  253  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0948  capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.58 
 
 		 500 aa  237  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2760  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  44.41 
 
 		 649 aa  211  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0643593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2453  capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.05 
 
 		 513 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2537  capsule polysaccharide biosynthesis protein  43.81 
 
 		 649 aa  211  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0644  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  42.38 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2465  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.78 
 
 		 650 aa  203  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0602481 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1286  capsule polysaccharide biosynthesis  44.66 
 
 		 437 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.395245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2085  capsule polysaccharide biosynthesis protein  48.26 
 
 		 373 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4999  capsule polysaccharide biosynthesis protein  38.54 
 
 		 341 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851528  normal  0.0115997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1310  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  37.67 
 
 		 747 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4993  capsule polysaccharide biosynthesis protein  39.21 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0145163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001779  region 2 capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1460 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.305745  hitchhiker  0.0036664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1514  capsule polysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 381 aa  45.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3256  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 		 398 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3268  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 		 398 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3217  capsule polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 		 398 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>